Nach mehr als 10 Jahren als Musik- und Physiklehrer ist Michael Pabst-Krueger seit nunmehr über 20 Jahren hauptamtlich in der Musiklehrerbildung tätig, zuerst an der Universität Kiel, ab 2002 als Dozent für Angewandte Musikpädagogik mit dem Arbeitsschwerpunkt schulische Musizierpraxis an der Musikhochschule Lübeck. Er promovierte 2005 über das Thema “Musikstunde-ONLINE: Musikpädagogische Fortbildung im Virtuellen Klassenraum”.
Michael Pabst-Krueger ist außerdem Inklusionsbeauftragter der Musikhochschule Lübeck, Gründungspräsident des Bundesverbandes Musikunterricht und Mitglied des Präsidiums des Deutschen Musikrats.